Курчатовский геномный центр

В России создадут ПО для автоматического сбора данных о микроорганизмах

СМИ о нас
Институт цитологии и генетики СО РАН в составе Курчатовского геномного центра разрабатывает информационную платформу, которая объединит информацию о свойствах микроорганизмов из научных статей и патентов. Внедрение системы позволит ускорить исследования в сферах микробиологии и селекции, сообщил на форуме "Технопром" научный руководитель ИЦиГ СО РАН Николай Колчанов.

"[Информация о микроорганизмах] распределена по миллионам научных статей, тысячам баз данных и многим сотням тысяч патентов. Ни один исследователь, если мы объективно смотрим, физически не может глубоко прочитать более 10 статей в день. А у нас их миллионы. В рамках разрабатываемой платформы создается программный модуль, <…> предназначенный для автоматического извлечения из этих источников знаний и фактов о структурно-функциональной организации микроорганизмов", - сказал Колчанов.

Он отметил, что система содержит 20 программных модулей для различных задач. Среди ее функций - создание в результате обработки источников данных собственной базы знаний, которая может применяться при проведении экспериментов по созданию штаммов продуцентов с заданными свойствами.

"Задача заключается в том, чтобы всем, кто занимается микробиологией, в первую очередь, промышленной, дать доступ к этим гигантским ресурсам, чтобы каждый мог по своим потребностям что-то получать", - уточнил он, добавив, что платформа будет готова для тестирования к июню 2024 года.

Заместитель руководителя Курчатовского комплекса НБИКС-природоподобных технологий НИЦ "Курчатовский институт" Александр Яненко в свою очередь напомнил, что в НИЦ "Курчатовский институт" в соответствии с поручением президента РФ создается Национальная база генетической информации, основой которой необходимо сделать отечественное программное обеспечение. Представленный проект "мог бы стать хорошим дополнением", добавил он.

X Международный форум технологического развития "Технопром" проходит в Новосибирске с 22 по 25 августа. Форум проводится при финансовой поддержке Минобрнауки России в рамках федерального проекта "Популяризация науки и технологий", а также правительства Новосибирской области. Агентство ТАСС выступает генеральным информационным партнером мероприятия.

Источник