Маркерную селекцию можно проводить применяя секвенирование и
смотреть полиморфизмы в определенных генах, но тут главное знать, где смотреть. Или второй способ - известная нам ПЦР, с ее помощью можно быстро посмотреть наличие маркеров, связанных и конкретными признаками и ускорить отбор при селекции.